Suplementi koji sadrže probiotike - "prijateljske" bakterije koje promiču probavno zdravlje i imunitet - sve su popularnije među zdravstvenim potrošačima. Prema Nacionalnom centru za komplementarnu i alternativnu medicinu (NCCAM), prodaja probiotika gotovo se utrostručila između 1994. i 2003. NCCAM primjećuje da probiotici pokazuju obećanje kao liječenje proljeva, sindroma iritabilnog crijeva, infekcije mokraćnog sustava i dječjeg ekcema. Ipak, kao i svi suplementi, probiotici su povezani s nekim nedostacima.
Nedovoljno dokaza
Medline Plus, služba Nacionalnog instituta za zdravstvo, napominje da su mnoge koristi za L. acidophilus - najpopularniji probiotik u svijetu - nedokazane. Iako dobri znanstveni dokazi podupiru uporabu acidofila kao liječenja bakterijske vaginoze, nije bilo dovoljno velikih dvostruko slijepih kliničkih ispitivanja koja bi u potpunosti utvrdila pojavu da probiotici mogu liječiti druge bolesti.
Gastrointestinalni nuspojave
Prema Nacionalnim institutima za zdravstvo, probiotici ponekad uzrokuju blagi nemir u plinovima ili želucu. Međutim, ova nuspojava obično smanjuje s nastavkom upotrebe. Ova nuspojava rijetko se primjećuje kod ljudi koji uzimaju umjereno male doze probiotika.
Mogućnost zaraze
Prema Nacionalnim institutima za zdravlje, ljudi s ozbiljno ugroženim imunološkim sustavom mogu doživjeti sistemsku infekciju nakon uzimanja probiotika. Ova po život opasna nuspojava izuzetno je rijetka. To je dokumentirano samo kod ljudi čiji su imunološki sustav ugroženi AIDS-om, lijekovima za kemoterapiju ili imunosupresivima.